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蛋白质组学分析

蛋白质是遗传基因的一种功能性单位。蛋白质是由20种氨基酸按照基因的编码通过肽键连接起来的多肽链,蛋白质的结构和功能取决于蛋白质氨基酸的排列顺序和翻译后的修饰。通过对氨基酸序列的分析,可以预测蛋白质的功能。随着近年来研究的深入,可以预测的内容包括:蛋白质的二级结构,信号肽(signal peptide),模序(motif),结构域(domain),活性中心(catalytic domain),跨膜区(transmembrane domain),蛋白质三级结构同源建模(homologue modeling )等。随着PDB数据库中解析的蛋白质结构数量的增加以及各种蛋白质结构比对算法的发展,人们对蛋白质结构的特征有了更深入的了解,在蛋白质三维结构的基础上,分析蛋白质的结构特性,寻找潜在的药物靶点,对于创新药物研发非常重要。

蛋白质组学研究比基因组学研究更接近实用,有着巨大的市场应用前景,尤其是在制药方面,蛋白质组学已经成为西方各主要发达国家、各跨国制药集团竞相投入的热点。蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。因此,我们在蛋白质组学研究中开展了大量工作,我们有专业的蛋白质结构研究专家,可以为您提供全面的蛋白质相关分析,为您提供最满意的服务。

我们的服务包括:

1)蛋白质序列分析

蛋白质的单一序列分析以及蛋白质的多序列比对分析。包括分析蛋白质序列的氨基酸组成、物理化学特性、活性位点残基组成以及活性位点信息、信号肽预测、序列基序、跨膜区。

2)蛋白质结构特征分析

蛋白质的结构特征分析包括结构特征元件组成、蛋白质结构分类、二级结构构象预测及组成分析、氢键类型分析、π键分析、表面分析、侧链分析等;蛋白质三维结构两两比较、多个蛋白质三维结构比较、基于结构的多序列比较等;蛋白质同源建模、分子对接、分子动力学模拟等。

3)蛋白质功能分析。

包括蛋白质功能预测、蛋白质功能注释、相互作用网络构建、功能域组分分析、代谢通路分析、疾病相关信号通路分析、抗原决定簇分析等等。

4)蛋白质进化分析。

包括基于蛋白质序列的进化分析、基于结构的蛋白质进化分析、基于全因组的蛋白质进化分析等。

通过对蛋白质结构进行分析,可以发现某些蛋白质是否是药物作用的靶标,进而分析药物可能作用的靶点。因此蛋白质结构特征分析在新药研发中非常关键。通过对蛋白质结构进行分析,结合蛋白质靶向小分子化合物虚拟筛选平台,我们成功发现两个具有抗耐药菌作用的小分子先导化合物。

蛋白质结构分析平台的构建旨在为国内外科研工作者提供蛋白质结构分析方面的服务,希望能够在新药研发中为大家提供帮助。